x <- array(list(NA ,NA ,38.6 ,6654 ,5712 ,645 ,3 ,5 ,3 ,6.3 ,2 ,4.5 ,1 ,6.6 ,42 ,3 ,1 ,3 ,NA ,NA ,14 ,3.385 ,44.5 ,60 ,1 ,1 ,1 ,NA ,NA ,NA ,0.92 ,5.7 ,25 ,5 ,2 ,3 ,2.1 ,1.8 ,69 ,2547 ,4603 ,624 ,3 ,5 ,4 ,9.1 ,0.7 ,27 ,10.55 ,179.5 ,180 ,4 ,4 ,4 ,15.8 ,3.9 ,19 ,0.023 ,0.3 ,35 ,1 ,1 ,1 ,5.2 ,1 ,30.4 ,160 ,169 ,392 ,4 ,5 ,4 ,10.9 ,3.6 ,28 ,3.3 ,25.6 ,63 ,1 ,2 ,1 ,8.3 ,1.4 ,50 ,52.16 ,440 ,230 ,1 ,1 ,1 ,11 ,1.5 ,7 ,0.425 ,6.4 ,112 ,5 ,4 ,4 ,3.2 ,0.7 ,30 ,465 ,423 ,281 ,5 ,5 ,5 ,7.6 ,2.7 ,NA ,0.55 ,2.4 ,NA ,2 ,1 ,2 ,NA ,NA ,40 ,187.1 ,419 ,365 ,5 ,5 ,5 ,6.3 ,2.1 ,3.5 ,0.075 ,1.2 ,42 ,1 ,1 ,1 ,8.6 ,0 ,50 ,3 ,25 ,28 ,2 ,2 ,2 ,6.6 ,4.1 ,6 ,0.785 ,3.5 ,42 ,2 ,2 ,2 ,9.5 ,1.2 ,10.4 ,0.2 ,5 ,120 ,2 ,2 ,2 ,4.8 ,1.3 ,34 ,1.41 ,17.5 ,NA ,1 ,2 ,1 ,12 ,6.1 ,7 ,60 ,81 ,NA ,1 ,1 ,1 ,NA ,0.3 ,28 ,529 ,680 ,400 ,5 ,5 ,5 ,3.3 ,0.5 ,20 ,27.66 ,115 ,148 ,5 ,5 ,5 ,11 ,3.4 ,3.9 ,0.12 ,1 ,16 ,3 ,1 ,2 ,NA ,NA ,39.3 ,207 ,406 ,252 ,1 ,4 ,1 ,4.7 ,1.5 ,41 ,85 ,325 ,310 ,1 ,3 ,1 ,NA ,NA ,16.2 ,36.33 ,119.5 ,63 ,1 ,1 ,1 ,10.4 ,3.4 ,9 ,0.101 ,4 ,28 ,5 ,1 ,3 ,7.4 ,0.8 ,7.6 ,1.04 ,5.5 ,68 ,5 ,3 ,4 ,2.1 ,0.8 ,46 ,521 ,655 ,336 ,5 ,5 ,5 ,NA ,NA ,22.4 ,100 ,157 ,100 ,1 ,1 ,1 ,NA ,NA ,16.3 ,35 ,56 ,33 ,3 ,5 ,4 ,7.7 ,1.4 ,2.6 ,0.005 ,0.14 ,21.5 ,5 ,2 ,4 ,17.9 ,2 ,24 ,0.01 ,0.25 ,50 ,1 ,1 ,1 ,6.1 ,1.9 ,100 ,62 ,1320 ,267 ,1 ,1 ,1 ,8.2 ,2.4 ,NA ,0.122 ,3 ,30 ,2 ,1 ,1 ,8.4 ,2.8 ,NA ,1.35 ,8.1 ,45 ,3 ,1 ,3 ,11.9 ,1.3 ,3.2 ,0.023 ,0.4 ,19 ,4 ,1 ,3 ,10.8 ,2 ,2 ,0.048 ,0.33 ,30 ,4 ,1 ,3 ,13.8 ,5.6 ,5 ,1.7 ,6.3 ,12 ,2 ,1 ,1 ,14.3 ,3.1 ,6.5 ,3.5 ,10.8 ,120 ,2 ,1 ,1 ,NA ,1 ,23.6 ,250 ,490 ,440 ,5 ,5 ,5 ,15.2 ,1.8 ,12 ,0.48 ,15.5 ,140 ,2 ,2 ,2 ,10 ,0.9 ,20.2 ,10 ,115 ,170 ,4 ,4 ,4 ,11.9 ,1.8 ,13 ,1.62 ,11.4 ,17 ,2 ,1 ,2 ,6.5 ,1.9 ,27 ,192 ,180 ,115 ,4 ,4 ,4 ,7.5 ,0.9 ,18 ,2.5 ,12.1 ,31 ,5 ,5 ,5 ,NA ,NA ,13.7 ,4.288 ,39.2 ,63 ,2 ,2 ,2 ,10.6 ,2.6 ,4.7 ,0.28 ,1.9 ,21 ,3 ,1 ,3 ,7.4 ,2.4 ,9.8 ,4.235 ,50.4 ,52 ,1 ,1 ,1 ,8.4 ,1.2 ,29 ,6.8 ,179 ,164 ,2 ,3 ,2 ,5.7 ,0.9 ,7 ,0.75 ,12.3 ,225 ,2 ,2 ,2 ,4.9 ,0.5 ,6 ,3.6 ,21 ,225 ,3 ,2 ,3 ,NA ,NA ,17 ,14.83 ,98.2 ,150 ,5 ,5 ,5 ,3.2 ,0.6 ,20 ,55.5 ,175 ,151 ,5 ,5 ,5 ,NA ,NA ,12.7 ,1.4 ,12.5 ,90 ,2 ,2 ,2 ,8.1 ,2.2 ,3.5 ,0.06 ,1 ,NA ,3 ,1 ,2 ,11 ,2.3 ,4.5 ,0.9 ,2.6 ,60 ,2 ,1 ,2 ,4.9 ,0.5 ,7.5 ,2 ,12.3 ,200 ,3 ,1 ,3 ,13.2 ,2.6 ,2.3 ,0.104 ,2.5 ,46 ,3 ,2 ,2 ,9.7 ,0.6 ,24 ,4.19 ,58 ,210 ,4 ,3 ,4 ,12.8 ,6.6 ,3 ,3.5 ,3.9 ,14 ,2 ,1 ,1 ,NA ,NA ,13 ,4.05 ,17 ,38 ,3 ,1 ,1) ,dim=c(9 ,62) ,dimnames=list(c('SWS' ,'PS' ,'L' ,'WB' ,'WBR' ,'TG' ,'P' ,'S' ,'D ') ,1:62)) y <- array(NA,dim=c(9,62),dimnames=list(c('SWS','PS','L','WB','WBR','TG','P','S','D '),1:62)) for (i in 1:dim(x)[1]) { for (j in 1:dim(x)[2]) { y[i,j] <- as.numeric(x[i,j]) } } par1 = 'spearman' main = 'Correlation Matrix' #'GNU S' R Code compiled by R2WASP v. 1.0.44 () #Author: Dr. Ian E. Holliday #To cite this work: Ian E. Holliday, 2009, YOUR SOFTWARE TITLE (vNUMBER) in Free Statistics Software (v$_version), Office for Research Development and Education, URL http://www.wessa.net/rwasp_YOURPAGE.wasp/ #Source of accompanying publication: #Technical description: panel.tau <- function(x, y, digits=2, prefix='', cex.cor) { usr <- par('usr'); on.exit(par(usr)) par(usr = c(0, 1, 0, 1)) rr <- cor.test(x, y, method=par1) r <- round(rr$p.value,2) txt <- format(c(r, 0.123456789), digits=digits)[1] txt <- paste(prefix, txt, sep='') if(missing(cex.cor)) cex <- 0.5/strwidth(txt) text(0.5, 0.5, txt, cex = cex) } panel.hist <- function(x, ...) { usr <- par('usr'); on.exit(par(usr)) par(usr = c(usr[1:2], 0, 1.5) ) h <- hist(x, plot = FALSE) breaks <- h$breaks; nB <- length(breaks) y <- h$counts; y <- y/max(y) rect(breaks[-nB], 0, breaks[-1], y, col='grey', ...) } postscript(file="/var/www/html/rcomp/tmp/1djsl1293035958.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) pairs(t(y),diag.panel=panel.hist, upper.panel=panel.smooth, lower.panel=panel.tau, main=main) dev.off() #Note: the /var/www/html/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab load(file="/var/www/html/rcomp/createtable") n <- length(y[,1]) n a<-table.start() a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,paste('Correlations for all pairs of data series (method=',par1,')',sep=''),n+1,TRUE) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,' ',header=TRUE) for (i in 1:n) { a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],header=TRUE) } a<-table.row.end(a) for (i in 1:n) { a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],header=TRUE) for (j in 1:n) { r <- cor.test(y[i,],y[j,],method=par1) a<-table.element(a,round(r$estimate,3)) } a<-table.row.end(a) } a<-table.end(a) table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/2gk891293035958.tab") a<-table.start() a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,'Correlations for all pairs of data series with p-values',4,TRUE) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,'pair',1,TRUE) a<-table.element(a,'Pearson r',1,TRUE) a<-table.element(a,'Spearman rho',1,TRUE) a<-table.element(a,'Kendall tau',1,TRUE) a<-table.row.end(a) cor.test(y[1,],y[2,],method=par1) for (i in 1:(n-1)) { for (j in (i+1):n) { a<-table.row.start(a) dum <- paste(dimnames(t(x))[[2]][i],';',dimnames(t(x))[[2]][j],sep='') a<-table.element(a,dum,header=TRUE) rp <- cor.test(y[i,],y[j,],method='pearson') a<-table.element(a,round(rp$estimate,4)) rs <- cor.test(y[i,],y[j,],method='spearman') a<-table.element(a,round(rs$estimate,4)) rk <- cor.test(y[i,],y[j,],method='kendall') a<-table.element(a,round(rk$estimate,4)) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,'p-value',header=T) a<-table.element(a,paste('(',round(rp$p.value,4),')',sep='')) a<-table.element(a,paste('(',round(rs$p.value,4),')',sep='')) a<-table.element(a,paste('(',round(rk$p.value,4),')',sep='')) a<-table.row.end(a) } } a<-table.end(a) table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/3uuo01293035958.tab") try(system("convert tmp/1djsl1293035958.ps tmp/1djsl1293035958.png",intern=TRUE))