R version 2.9.0 (2009-04-17) Copyright (C) 2009 The R Foundation for Statistical Computing ISBN 3-900051-07-0 R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. You are welcome to redistribute it under certain conditions. Type 'license()' or 'licence()' for distribution details. R is a collaborative project with many contributors. Type 'contributors()' for more information and 'citation()' on how to cite R or R packages in publications. Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or 'help.start()' for an HTML browser interface to help. Type 'q()' to quit R. > x <- array(list(0 + ,1 + ,4 + ,4 + ,2 + ,0 + ,1 + ,2 + ,2 + ,2 + ,0 + ,1 + ,5 + ,5 + ,4 + ,1 + ,1 + ,4 + ,5 + ,3 + ,0 + ,2 + ,1 + ,1 + ,2 + ,0 + ,1 + ,2 + ,4 + ,1 + ,0 + ,4 + ,5 + ,6 + ,4 + ,0 + ,1 + ,1 + ,5 + ,3 + ,0 + ,1 + ,3 + ,4 + ,1 + ,0 + ,2 + ,5 + ,5 + ,4 + ,1 + ,1 + ,2 + ,7 + ,4 + ,0 + ,1 + ,2 + ,2 + ,4 + ,1 + ,2 + ,2 + ,7 + ,3 + ,0 + ,1 + ,2 + ,5 + ,4 + ,0 + ,1 + ,1 + ,5 + ,1 + ,1 + ,1 + ,4 + ,7 + ,4 + ,1 + ,1 + ,3 + ,3 + ,1 + ,0 + ,1 + ,6 + ,6 + ,4 + ,1 + ,1 + ,1 + ,2 + ,4 + ,0 + ,2 + ,3 + ,6 + ,3 + ,1 + ,1 + ,2 + ,1 + ,2 + ,0 + ,2 + ,5 + ,5 + ,6 + ,0 + ,1 + ,5 + ,4 + ,5 + ,0 + ,2 + ,3 + ,4 + ,4 + ,1 + ,1 + ,3 + ,7 + ,6 + ,0 + ,1 + ,5 + ,7 + ,1 + ,1 + ,1 + ,5 + ,5 + ,2 + ,0 + ,2 + ,4 + ,6 + ,4 + ,1 + ,1 + ,2 + ,5 + ,4 + ,0 + ,1 + ,1 + ,1 + ,1 + ,1 + ,2 + ,4 + ,6 + ,2 + ,0 + ,1 + ,6 + ,4 + ,1 + ,0 + ,1 + ,2 + ,2 + ,2 + ,1 + ,1 + ,3 + ,2 + ,2 + ,1 + ,1 + ,2 + ,6 + ,2 + ,1 + ,2 + ,4 + ,6 + ,6 + ,1 + ,1 + ,2 + ,6 + ,2 + ,0 + ,1 + ,1 + ,1 + ,1 + ,1 + ,1 + ,5 + ,6 + ,4 + ,1 + ,1 + ,5 + ,6 + ,3 + ,0 + ,1 + ,1 + ,1 + ,3 + ,1 + ,1 + ,1 + ,1 + ,1 + ,1 + ,1 + ,2 + ,7 + ,4 + ,0 + ,1 + ,4 + ,2 + ,3 + ,0 + ,1 + ,5 + ,3 + ,4 + ,0 + ,1 + ,3 + ,5 + ,3 + ,0 + ,1 + ,3 + ,3 + ,2 + ,1 + ,1 + ,1 + ,4 + ,1 + ,0 + ,1 + ,2 + ,2 + ,5 + ,1 + ,1 + ,3 + ,3 + ,4 + ,1 + ,2 + ,2 + ,7 + ,1 + ,0 + ,2 + ,5 + ,7 + ,2 + ,1 + ,1 + ,4 + ,5 + ,4 + ,0 + ,1 + ,4 + ,1 + ,3 + ,0 + ,1 + ,2 + ,2 + ,2 + ,0 + ,2 + ,3 + ,5 + ,3 + ,1 + ,1 + ,6 + ,2 + ,3 + ,0 + ,1 + ,2 + ,4 + ,2 + ,1 + ,2 + ,3 + ,7 + ,2 + ,1 + ,1 + ,2 + ,2 + ,4 + ,0 + ,1 + ,5 + ,5 + ,4 + ,0 + ,1 + ,5 + ,6 + ,2 + ,0 + ,1 + ,5 + ,3 + ,2 + ,1 + ,1 + ,6 + ,7 + ,5 + ,0 + ,2 + ,4 + ,4 + ,4 + ,1 + ,1 + ,2 + ,3 + ,5 + ,0 + ,1 + ,5 + ,5 + ,5 + ,1 + ,2 + ,2 + ,3 + ,2 + ,1 + ,1 + ,1 + ,2 + ,3 + ,0 + ,1 + ,6 + ,6 + ,4 + ,0 + ,1 + ,6 + ,6 + ,2 + ,1 + ,1 + ,3 + ,5 + ,2 + ,1 + ,1 + ,4 + ,2 + ,2 + ,0 + ,3 + ,5 + ,3 + ,5 + ,0 + ,2 + ,2 + ,4 + ,2 + ,0 + ,2 + ,4 + ,6 + ,3 + ,1 + ,1 + ,3 + ,5 + ,2 + ,1 + ,1 + ,2 + ,2 + ,2 + ,1 + ,1 + ,2 + ,5 + ,2 + ,1 + ,1 + ,3 + ,2 + ,2 + ,0 + ,1 + ,3 + ,1 + ,2 + ,1 + ,1 + ,7 + ,2 + ,1 + ,0 + ,1 + ,2 + ,4 + ,3 + ,0 + ,1 + ,2 + ,5 + ,3 + ,1 + ,1 + ,2 + ,5 + ,3 + ,0 + ,1 + ,5 + ,3 + ,3 + ,0 + ,1 + ,1 + ,2 + ,1 + ,0 + ,3 + ,5 + ,7 + ,4 + ,0 + ,1 + ,2 + ,1 + ,1 + ,0 + ,1 + ,1 + ,5 + ,1 + ,0 + ,1 + ,2 + ,5 + ,1 + ,0 + ,1 + ,2 + ,2 + ,3 + ,0 + ,1 + ,0 + ,6 + ,2 + ,0 + ,1 + ,5 + ,2 + ,3 + ,0 + ,1 + ,3 + ,5 + ,5 + ,0 + ,1 + ,2 + ,3 + ,3 + ,1 + ,1 + ,4 + ,3 + ,2 + ,1 + ,1 + ,2 + ,5 + ,2 + ,0 + ,1 + ,2 + ,5 + ,3 + ,1 + ,2 + ,4 + ,5 + ,4 + ,0 + ,1 + ,1 + ,6 + ,4 + ,1 + ,1 + ,5 + ,5 + ,3 + ,0 + ,1 + ,4 + ,5 + ,2 + ,1 + ,2 + ,6 + ,6 + ,3 + ,0 + ,1 + ,2 + ,2 + ,3 + ,1 + ,2 + ,5 + ,5 + ,4 + ,1 + ,2 + ,1 + ,5 + ,2 + ,0 + ,3 + ,7 + ,1 + ,5 + ,0 + ,2 + ,5 + ,5 + ,2 + ,0 + ,2 + ,3 + ,6 + ,2 + ,0 + ,1 + ,4 + ,6 + ,4 + ,1 + ,1 + ,4 + ,3 + ,5 + ,0 + ,1 + ,2 + ,3 + ,0 + ,1 + ,1 + ,1 + ,3 + ,1 + ,0 + ,1 + ,6 + ,5 + ,6 + ,0 + ,1 + ,4 + ,5 + ,1 + ,0 + ,1 + ,2 + ,2 + ,2 + ,0 + ,2 + ,7 + ,3 + ,1 + ,0 + ,1 + ,4 + ,3 + ,4 + ,0 + ,1 + ,4 + ,6 + ,2 + ,0 + ,1 + ,4 + ,5 + ,4 + ,0 + ,1 + ,2 + ,2 + ,1 + ,0 + ,1 + ,5 + ,4 + ,4 + ,1 + ,1 + ,3 + ,2 + ,3 + ,0 + ,1 + ,2 + ,2 + ,1 + ,0 + ,1 + ,3 + ,5 + ,2 + ,0 + ,1 + ,4 + ,5 + ,5 + ,1 + ,2 + ,5 + ,4 + ,3 + ,1 + ,2 + ,6 + ,5 + ,2 + ,0 + ,1 + ,2 + ,1 + ,2 + ,1 + ,1 + ,2 + ,5 + ,4 + ,1 + ,1 + ,2 + ,5 + ,4 + ,0 + ,1 + ,2 + ,5 + ,4 + ,1 + ,4 + ,2 + ,6 + ,4 + ,1 + ,1 + ,5 + ,5 + ,4 + ,0 + ,2 + ,2 + ,5 + ,4 + ,0 + ,1 + ,3 + ,6 + ,2 + ,1 + ,1 + ,6 + ,5 + ,4 + ,0 + ,1 + ,4 + ,5 + ,2 + ,1 + ,1 + ,5 + ,7 + ,2 + ,0 + ,1 + ,1 + ,1 + ,1 + ,1 + ,1 + ,2 + ,3 + ,3 + ,0 + ,1 + ,2 + ,5 + ,2 + ,0 + ,1 + ,2 + ,5 + ,1 + ,1 + ,1 + ,6 + ,6 + ,3 + ,1 + ,1 + ,2 + ,4 + ,3 + ,0 + ,1 + ,2 + ,2 + ,2 + ,0 + ,2 + ,1 + ,4 + ,5 + ,1 + ,1 + ,5 + ,5 + ,2 + ,0 + ,1 + ,3 + ,5 + ,5 + ,0 + ,3 + ,6 + ,5 + ,4 + ,0 + ,1 + ,1 + ,5 + ,1) + ,dim=c(5 + ,152) + ,dimnames=list(c('Gender' + ,'Depressed' + ,'Cannotdo' + ,'Worrytoomuch' + ,'Limitactivity') + ,1:152)) > y <- array(NA,dim=c(5,152),dimnames=list(c('Gender','Depressed','Cannotdo','Worrytoomuch','Limitactivity'),1:152)) > for (i in 1:dim(x)[1]) + { + for (j in 1:dim(x)[2]) + { + y[i,j] <- as.numeric(x[i,j]) + } + } > par4 = 'no' > par3 = '3' > par2 = 'none' > par1 = '2' > #'GNU S' R Code compiled by R2WASP v. 1.0.44 () > #Author: Dr. Ian E. Holliday > #To cite this work: Ian E. Holliday, 2009, YOUR SOFTWARE TITLE (vNUMBER) in Free Statistics Software (v$_version), Office for Research Development and Education, URL http://www.wessa.net/rwasp_YOURPAGE.wasp/ > #Source of accompanying publication: > #Technical description: > library(party) Loading required package: survival Loading required package: splines Loading required package: grid Loading required package: modeltools Loading required package: stats4 Loading required package: coin Loading required package: mvtnorm Loading required package: zoo Attaching package: 'zoo' The following object(s) are masked from package:base : as.Date.numeric Loading required package: sandwich Loading required package: strucchange Loading required package: vcd Loading required package: MASS Loading required package: colorspace > library(Hmisc) Attaching package: 'Hmisc' The following object(s) are masked from package:survival : untangle.specials The following object(s) are masked from package:base : format.pval, round.POSIXt, trunc.POSIXt, units > par1 <- as.numeric(par1) > par3 <- as.numeric(par3) > x <- data.frame(t(y)) > is.data.frame(x) [1] TRUE > x <- x[!is.na(x[,par1]),] > k <- length(x[1,]) > n <- length(x[,1]) > colnames(x)[par1] [1] "Depressed" > x[,par1] [1] 1 1 1 1 2 1 4 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 2 1 [38] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 3 [75] 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 2 3 2 2 1 [112] 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 4 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 [149] 1 1 3 1 > if (par2 == 'kmeans') { + cl <- kmeans(x[,par1], par3) + print(cl) + clm <- matrix(cbind(cl$centers,1:par3),ncol=2) + clm <- clm[sort.list(clm[,1]),] + for (i in 1:par3) { + cl$cluster[cl$cluster==clm[i,2]] <- paste('C',i,sep='') + } + cl$cluster <- as.factor(cl$cluster) + print(cl$cluster) + x[,par1] <- cl$cluster + } > if (par2 == 'quantiles') { + x[,par1] <- cut2(x[,par1],g=par3) + } > if (par2 == 'hclust') { + hc <- hclust(dist(x[,par1])^2, 'cen') + print(hc) + memb <- cutree(hc, k = par3) + dum <- c(mean(x[memb==1,par1])) + for (i in 2:par3) { + dum <- c(dum, mean(x[memb==i,par1])) + } + hcm <- matrix(cbind(dum,1:par3),ncol=2) + hcm <- hcm[sort.list(hcm[,1]),] + for (i in 1:par3) { + memb[memb==hcm[i,2]] <- paste('C',i,sep='') + } + memb <- as.factor(memb) + print(memb) + x[,par1] <- memb + } > if (par2=='equal') { + ed <- cut(as.numeric(x[,par1]),par3,labels=paste('C',1:par3,sep='')) + x[,par1] <- as.factor(ed) + } > table(x[,par1]) 1 2 3 4 118 28 4 2 > colnames(x) [1] "Gender" "Depressed" "Cannotdo" "Worrytoomuch" [5] "Limitactivity" > colnames(x)[par1] [1] "Depressed" > x[,par1] [1] 1 1 1 1 2 1 4 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 2 1 [38] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 3 [75] 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 2 3 2 2 1 [112] 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 4 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 [149] 1 1 3 1 > if (par2 == 'none') { + m <- ctree(as.formula(paste(colnames(x)[par1],' ~ .',sep='')),data = x) + } > > #Note: the /var/www/html/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab > load(file="/var/www/html/rcomp/createtable") > > if (par2 != 'none') { + m <- ctree(as.formula(paste('as.factor(',colnames(x)[par1],') ~ .',sep='')),data = x) + if (par4=='yes') { + a<-table.start() + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'10-Fold Cross Validation',3+2*par3,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'',1,TRUE) + a<-table.element(a,'Prediction (training)',par3+1,TRUE) + a<-table.element(a,'Prediction (testing)',par3+1,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Actual',1,TRUE) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,paste('C',jjj,sep=''),1,TRUE) + a<-table.element(a,'CV',1,TRUE) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,paste('C',jjj,sep=''),1,TRUE) + a<-table.element(a,'CV',1,TRUE) + a<-table.row.end(a) + for (i in 1:10) { + ind <- sample(2, nrow(x), replace=T, prob=c(0.9,0.1)) + m.ct <- ctree(as.formula(paste('as.factor(',colnames(x)[par1],') ~ .',sep='')),data =x[ind==1,]) + if (i==1) { + m.ct.i.pred <- predict(m.ct, newdata=x[ind==1,]) + m.ct.i.actu <- x[ind==1,par1] + m.ct.x.pred <- predict(m.ct, newdata=x[ind==2,]) + m.ct.x.actu <- x[ind==2,par1] + } else { + m.ct.i.pred <- c(m.ct.i.pred,predict(m.ct, newdata=x[ind==1,])) + m.ct.i.actu <- c(m.ct.i.actu,x[ind==1,par1]) + m.ct.x.pred <- c(m.ct.x.pred,predict(m.ct, newdata=x[ind==2,])) + m.ct.x.actu <- c(m.ct.x.actu,x[ind==2,par1]) + } + } + print(m.ct.i.tab <- table(m.ct.i.actu,m.ct.i.pred)) + numer <- 0 + for (i in 1:par3) { + print(m.ct.i.tab[i,i] / sum(m.ct.i.tab[i,])) + numer <- numer + m.ct.i.tab[i,i] + } + print(m.ct.i.cp <- numer / sum(m.ct.i.tab)) + print(m.ct.x.tab <- table(m.ct.x.actu,m.ct.x.pred)) + numer <- 0 + for (i in 1:par3) { + print(m.ct.x.tab[i,i] / sum(m.ct.x.tab[i,])) + numer <- numer + m.ct.x.tab[i,i] + } + print(m.ct.x.cp <- numer / sum(m.ct.x.tab)) + for (i in 1:par3) { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,paste('C',i,sep=''),1,TRUE) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,m.ct.i.tab[i,jjj]) + a<-table.element(a,round(m.ct.i.tab[i,i]/sum(m.ct.i.tab[i,]),4)) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,m.ct.x.tab[i,jjj]) + a<-table.element(a,round(m.ct.x.tab[i,i]/sum(m.ct.x.tab[i,]),4)) + a<-table.row.end(a) + } + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Overall',1,TRUE) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,'-') + a<-table.element(a,round(m.ct.i.cp,4)) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,'-') + a<-table.element(a,round(m.ct.x.cp,4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.end(a) + table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/1yrcu1292774888.tab") + } + } > m Conditional inference tree with 3 terminal nodes Response: Depressed Inputs: Gender, Cannotdo, Worrytoomuch, Limitactivity Number of observations: 152 1) Worrytoomuch <= 5; criterion = 0.973, statistic = 7.337 2) Cannotdo <= 4; criterion = 0.996, statistic = 10.666 3)* weights = 89 2) Cannotdo > 4 4)* weights = 28 1) Worrytoomuch > 5 5)* weights = 35 > postscript(file="/var/www/html/rcomp/tmp/2yrcu1292774888.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > plot(m) > dev.off() null device 1 > postscript(file="/var/www/html/rcomp/tmp/391uf1292774888.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > plot(x[,par1] ~ as.factor(where(m)),main='Response by Terminal Node',xlab='Terminal Node',ylab='Response') > dev.off() null device 1 > if (par2 == 'none') { + forec <- predict(m) + result <- as.data.frame(cbind(x[,par1],forec,x[,par1]-forec)) + colnames(result) <- c('Actuals','Forecasts','Residuals') + print(result) + } Actuals Forecasts Residuals 1 1 1.112360 -0.1123596 2 1 1.112360 -0.1123596 3 1 1.464286 -0.4642857 4 1 1.112360 -0.1123596 5 2 1.112360 0.8876404 6 1 1.112360 -0.1123596 7 4 1.542857 2.4571429 8 1 1.112360 -0.1123596 9 1 1.112360 -0.1123596 10 2 1.464286 0.5357143 11 1 1.542857 -0.5428571 12 1 1.112360 -0.1123596 13 2 1.542857 0.4571429 14 1 1.112360 -0.1123596 15 1 1.112360 -0.1123596 16 1 1.542857 -0.5428571 17 1 1.112360 -0.1123596 18 1 1.542857 -0.5428571 19 1 1.112360 -0.1123596 20 2 1.542857 0.4571429 21 1 1.112360 -0.1123596 22 2 1.464286 0.5357143 23 1 1.464286 -0.4642857 24 2 1.112360 0.8876404 25 1 1.542857 -0.5428571 26 1 1.542857 -0.5428571 27 1 1.464286 -0.4642857 28 2 1.542857 0.4571429 29 1 1.112360 -0.1123596 30 1 1.112360 -0.1123596 31 2 1.542857 0.4571429 32 1 1.464286 -0.4642857 33 1 1.112360 -0.1123596 34 1 1.112360 -0.1123596 35 1 1.542857 -0.5428571 36 2 1.542857 0.4571429 37 1 1.542857 -0.5428571 38 1 1.112360 -0.1123596 39 1 1.542857 -0.5428571 40 1 1.542857 -0.5428571 41 1 1.112360 -0.1123596 42 1 1.112360 -0.1123596 43 1 1.542857 -0.5428571 44 1 1.112360 -0.1123596 45 1 1.464286 -0.4642857 46 1 1.112360 -0.1123596 47 1 1.112360 -0.1123596 48 1 1.112360 -0.1123596 49 1 1.112360 -0.1123596 50 1 1.112360 -0.1123596 51 2 1.542857 0.4571429 52 2 1.542857 0.4571429 53 1 1.112360 -0.1123596 54 1 1.112360 -0.1123596 55 1 1.112360 -0.1123596 56 2 1.112360 0.8876404 57 1 1.464286 -0.4642857 58 1 1.112360 -0.1123596 59 2 1.542857 0.4571429 60 1 1.112360 -0.1123596 61 1 1.464286 -0.4642857 62 1 1.542857 -0.5428571 63 1 1.464286 -0.4642857 64 1 1.542857 -0.5428571 65 2 1.112360 0.8876404 66 1 1.112360 -0.1123596 67 1 1.464286 -0.4642857 68 2 1.112360 0.8876404 69 1 1.112360 -0.1123596 70 1 1.542857 -0.5428571 71 1 1.542857 -0.5428571 72 1 1.112360 -0.1123596 73 1 1.112360 -0.1123596 74 3 1.464286 1.5357143 75 2 1.112360 0.8876404 76 2 1.542857 0.4571429 77 1 1.112360 -0.1123596 78 1 1.112360 -0.1123596 79 1 1.112360 -0.1123596 80 1 1.112360 -0.1123596 81 1 1.112360 -0.1123596 82 1 1.464286 -0.4642857 83 1 1.112360 -0.1123596 84 1 1.112360 -0.1123596 85 1 1.112360 -0.1123596 86 1 1.464286 -0.4642857 87 1 1.112360 -0.1123596 88 3 1.542857 1.4571429 89 1 1.112360 -0.1123596 90 1 1.112360 -0.1123596 91 1 1.112360 -0.1123596 92 1 1.112360 -0.1123596 93 1 1.542857 -0.5428571 94 1 1.464286 -0.4642857 95 1 1.112360 -0.1123596 96 1 1.112360 -0.1123596 97 1 1.112360 -0.1123596 98 1 1.112360 -0.1123596 99 1 1.112360 -0.1123596 100 2 1.112360 0.8876404 101 1 1.542857 -0.5428571 102 1 1.464286 -0.4642857 103 1 1.112360 -0.1123596 104 2 1.542857 0.4571429 105 1 1.112360 -0.1123596 106 2 1.464286 0.5357143 107 2 1.112360 0.8876404 108 3 1.464286 1.5357143 109 2 1.464286 0.5357143 110 2 1.542857 0.4571429 111 1 1.542857 -0.5428571 112 1 1.112360 -0.1123596 113 1 1.112360 -0.1123596 114 1 1.112360 -0.1123596 115 1 1.464286 -0.4642857 116 1 1.112360 -0.1123596 117 1 1.112360 -0.1123596 118 2 1.464286 0.5357143 119 1 1.112360 -0.1123596 120 1 1.542857 -0.5428571 121 1 1.112360 -0.1123596 122 1 1.112360 -0.1123596 123 1 1.464286 -0.4642857 124 1 1.112360 -0.1123596 125 1 1.112360 -0.1123596 126 1 1.112360 -0.1123596 127 1 1.112360 -0.1123596 128 2 1.464286 0.5357143 129 2 1.464286 0.5357143 130 1 1.112360 -0.1123596 131 1 1.112360 -0.1123596 132 1 1.112360 -0.1123596 133 1 1.112360 -0.1123596 134 4 1.542857 2.4571429 135 1 1.464286 -0.4642857 136 2 1.112360 0.8876404 137 1 1.542857 -0.5428571 138 1 1.464286 -0.4642857 139 1 1.112360 -0.1123596 140 1 1.542857 -0.5428571 141 1 1.112360 -0.1123596 142 1 1.112360 -0.1123596 143 1 1.112360 -0.1123596 144 1 1.112360 -0.1123596 145 1 1.542857 -0.5428571 146 1 1.112360 -0.1123596 147 1 1.112360 -0.1123596 148 2 1.112360 0.8876404 149 1 1.464286 -0.4642857 150 1 1.112360 -0.1123596 151 3 1.464286 1.5357143 152 1 1.112360 -0.1123596 > if (par2 != 'none') { + print(cbind(as.factor(x[,par1]),predict(m))) + myt <- table(as.factor(x[,par1]),predict(m)) + print(myt) + } > postscript(file="/var/www/html/rcomp/tmp/41abz1292774888.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > if(par2=='none') { + op <- par(mfrow=c(2,2)) + plot(density(result$Actuals),main='Kernel Density Plot of Actuals') + plot(density(result$Residuals),main='Kernel Density Plot of Residuals') + plot(result$Forecasts,result$Actuals,main='Actuals versus Predictions',xlab='Predictions',ylab='Actuals') + plot(density(result$Forecasts),main='Kernel Density Plot of Predictions') + par(op) + } > if(par2!='none') { + plot(myt,main='Confusion Matrix',xlab='Actual',ylab='Predicted') + } > dev.off() null device 1 > if (par2 == 'none') { + detcoef <- cor(result$Forecasts,result$Actuals) + a<-table.start() + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Goodness of Fit',2,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Correlation',1,TRUE) + a<-table.element(a,round(detcoef,4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'R-squared',1,TRUE) + a<-table.element(a,round(detcoef*detcoef,4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'RMSE',1,TRUE) + a<-table.element(a,round(sqrt(mean((result$Residuals)^2)),4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.end(a) + table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/5na951292774888.tab") + a<-table.start() + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Actuals, Predictions, and Residuals',4,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'#',header=TRUE) + a<-table.element(a,'Actuals',header=TRUE) + a<-table.element(a,'Forecasts',header=TRUE) + a<-table.element(a,'Residuals',header=TRUE) + a<-table.row.end(a) + for (i in 1:length(result$Actuals)) { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,i,header=TRUE) + a<-table.element(a,result$Actuals[i]) + a<-table.element(a,result$Forecasts[i]) + a<-table.element(a,result$Residuals[i]) + a<-table.row.end(a) + } + a<-table.end(a) + table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/68bqt1292774888.tab") + } > if (par2 != 'none') { + a<-table.start() + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Confusion Matrix (predicted in columns / actuals in rows)',par3+1,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'',1,TRUE) + for (i in 1:par3) { + a<-table.element(a,paste('C',i,sep=''),1,TRUE) + } + a<-table.row.end(a) + for (i in 1:par3) { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,paste('C',i,sep=''),1,TRUE) + for (j in 1:par3) { + a<-table.element(a,myt[i,j]) + } + a<-table.row.end(a) + } + a<-table.end(a) + table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/7jk7e1292774888.tab") + } > > try(system("convert tmp/2yrcu1292774888.ps tmp/2yrcu1292774888.png",intern=TRUE)) character(0) > try(system("convert tmp/391uf1292774888.ps tmp/391uf1292774888.png",intern=TRUE)) character(0) > try(system("convert tmp/41abz1292774888.ps tmp/41abz1292774888.png",intern=TRUE)) character(0) > > > proc.time() user system elapsed 2.752 0.664 6.086