R version 2.9.0 (2009-04-17) Copyright (C) 2009 The R Foundation for Statistical Computing ISBN 3-900051-07-0 R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. You are welcome to redistribute it under certain conditions. Type 'license()' or 'licence()' for distribution details. R is a collaborative project with many contributors. Type 'contributors()' for more information and 'citation()' on how to cite R or R packages in publications. Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or 'help.start()' for an HTML browser interface to help. Type 'q()' to quit R. > x <- array(list(2 + ,1 + ,22 + ,15 + ,16 + ,17 + ,10 + ,1 + ,2 + ,22 + ,23 + ,24 + ,42 + ,9 + ,1 + ,2 + ,22 + ,26 + ,22 + ,39 + ,30 + ,1 + ,2 + ,23 + ,19 + ,21 + ,22 + ,18 + ,1 + ,2 + ,21 + ,19 + ,23 + ,20 + ,16 + ,1 + ,2 + ,21 + ,16 + ,23 + ,31 + ,20 + ,1 + ,1 + ,24 + ,23 + ,21 + ,42 + ,20 + ,2 + ,1 + ,22 + ,22 + ,20 + ,30 + ,18 + ,1 + ,2 + ,21 + ,19 + ,22 + ,33 + ,21 + ,1 + ,2 + ,23 + ,24 + ,20 + ,29 + ,20 + ,1 + ,1 + ,20 + ,19 + ,12 + ,31 + ,20 + ,2 + ,1 + ,23 + ,25 + ,23 + ,39 + ,20 + ,1 + ,1 + ,20 + ,23 + ,23 + ,44 + ,29 + ,1 + ,2 + ,21 + ,31 + ,30 + ,40 + ,14 + ,2 + ,1 + ,22 + ,29 + ,22 + ,42 + ,25 + ,2 + ,2 + ,22 + ,18 + ,21 + ,28 + ,19 + ,2 + ,2 + ,21 + ,17 + ,21 + ,29 + ,19 + ,1 + ,1 + ,20 + ,22 + ,15 + ,35 + ,25 + ,1 + ,1 + ,21 + ,21 + ,22 + ,26 + ,25 + ,1 + ,2 + ,21 + ,24 + ,24 + ,42 + ,19 + ,1 + ,1 + ,20 + ,22 + ,23 + ,26 + ,19 + ,1 + ,1 + ,21 + ,16 + ,15 + ,30 + ,18 + ,1 + ,2 + ,23 + ,22 + ,24 + ,28 + ,24 + ,1 + ,1 + ,23 + ,21 + ,24 + ,24 + ,18 + ,2 + ,1 + ,21 + ,25 + ,21 + ,26 + ,26 + ,1 + ,1 + ,22 + ,22 + ,21 + ,39 + ,26 + ,2 + ,1 + ,20 + ,24 + ,18 + ,33 + ,24 + ,2 + ,1 + ,23 + ,21 + ,20 + ,50 + ,29 + ,2 + ,1 + ,21 + ,25 + ,19 + ,40 + ,26 + ,1 + ,1 + ,21 + ,29 + ,29 + ,49 + ,28 + ,2 + ,1 + ,23 + ,19 + ,20 + ,31 + ,18 + ,2 + ,1 + ,23 + ,29 + ,23 + ,37 + ,19 + ,2 + ,2 + ,22 + ,25 + ,24 + ,29 + ,21 + ,1 + ,1 + ,21 + ,19 + ,27 + ,37 + ,13 + ,1 + ,1 + ,NA + ,27 + ,28 + ,16 + ,19 + ,1 + ,2 + ,21 + ,25 + ,24 + ,28 + ,26 + ,1 + ,2 + ,21 + ,23 + ,29 + ,29 + ,17 + ,1 + ,1 + ,22 + ,24 + ,24 + ,31 + ,19 + ,2 + ,2 + ,22 + ,23 + ,22 + ,34 + ,28 + ,1 + ,2 + ,22 + ,25 + ,25 + ,30 + ,15 + ,1 + ,1 + ,22 + ,26 + ,24 + ,31 + ,16 + ,1 + ,1 + ,23 + ,23 + ,14 + ,44 + ,18 + ,2 + ,1 + ,NA + ,22 + ,22 + ,35 + ,25 + ,1 + ,2 + ,22 + ,32 + ,24 + ,47 + ,15 + ,1 + ,2 + ,21 + ,22 + ,24 + ,39 + ,24 + ,1 + ,1 + ,23 + ,18 + ,24 + ,34 + ,24 + ,2 + ,1 + ,21 + ,19 + ,24 + ,15 + ,14 + ,2 + ,2 + ,32 + ,23 + ,22 + ,26 + ,19 + ,2 + ,2 + ,32 + ,24 + ,22 + ,25 + ,20 + ,2 + ,1 + ,21 + ,19 + ,21 + ,30 + ,27 + ,1 + ,1 + ,20 + ,16 + ,21 + ,25 + ,20 + ,1 + ,1 + ,21 + ,23 + ,21 + ,33 + ,25 + ,1 + ,1 + ,22 + ,17 + ,15 + ,39 + ,16 + ,1 + ,1 + ,21 + ,17 + ,26 + ,24 + ,19 + ,1 + ,2 + ,21 + ,28 + ,22 + ,44 + ,15 + ,1 + ,2 + ,21 + ,24 + ,24 + ,31 + ,17 + ,1 + ,1 + ,22 + ,21 + ,13 + ,30 + ,22 + ,1 + ,1 + ,21 + ,14 + ,19 + ,21 + ,19 + ,2 + ,1 + ,25 + ,21 + ,10 + ,38 + ,44 + ,1 + ,2 + ,22 + ,20 + ,28 + ,30 + ,19 + ,1 + ,1 + ,21 + ,25 + ,25 + ,31 + ,19 + ,2 + ,2 + ,21 + ,20 + ,24 + ,32 + ,23 + ,1 + ,1 + ,20 + ,17 + ,22 + ,34 + ,19 + ,1 + ,2 + ,21 + ,26 + ,30 + ,43 + ,28 + ,1 + ,2 + ,22 + ,17 + ,22 + ,29 + ,17 + ,4 + ,2 + ,21 + ,17 + ,24 + ,40 + ,22 + ,1 + ,2 + ,23 + ,24 + ,23 + ,31 + ,25 + ,1 + ,2 + ,24 + ,30 + ,20 + ,36 + ,44 + ,2 + ,1 + ,20 + ,25 + ,22 + ,39 + ,19 + ,2 + ,1 + ,21 + ,15 + ,22 + ,31 + ,21 + ,1 + ,1 + ,23 + ,25 + ,19 + ,36 + ,25 + ,1 + ,1 + ,24 + ,18 + ,24 + ,36 + ,28 + ,1 + ,1 + ,22 + ,20 + ,22 + ,36 + ,19 + ,1 + ,1 + ,22 + ,32 + ,26 + ,41 + ,33 + ,2 + ,2 + ,21 + ,14 + ,12 + ,23 + ,19 + ,2 + ,1 + ,20 + ,20 + ,25 + ,23 + ,12 + ,1 + ,2 + ,21 + ,25 + ,29 + ,34 + ,15 + ,1 + ,NA + ,21 + ,25 + ,23 + ,31 + ,23 + ,1 + ,1 + ,22 + ,25 + ,23 + ,26 + ,21 + ,1 + ,1 + ,21 + ,35 + ,17 + ,32 + ,29 + ,1 + ,2 + ,21 + ,29 + ,26 + ,48 + ,15 + ,1 + ,1 + ,22 + ,25 + ,27 + ,37 + ,23 + ,1 + ,2 + ,23 + ,21 + ,23 + ,31 + ,25 + ,1 + ,1 + ,23 + ,21 + ,20 + ,29 + ,18 + ,1 + ,1 + ,21 + ,24 + ,24 + ,44 + ,24 + ,1 + ,1 + ,22 + ,26 + ,22 + ,27 + ,20 + ,1 + ,1 + ,24 + ,24 + ,26 + ,31 + ,19 + ,1 + ,2 + ,21 + ,20 + ,29 + ,37 + ,21 + ,1 + ,1 + ,25 + ,24 + ,20 + ,31 + ,33 + ,2 + ,1 + ,24 + ,18 + ,17 + ,29 + ,17 + ,1 + ,1 + ,21 + ,17 + ,16 + ,25 + ,19 + ,1 + ,2 + ,21 + ,22 + ,24 + ,39 + ,19 + ,1 + ,1 + ,22 + ,22 + ,24 + ,33 + ,23 + ,1 + ,1 + ,22 + ,22 + ,19 + ,26 + ,21 + ,2 + ,1 + ,21 + ,24 + ,29 + ,39 + ,20 + ,1 + ,1 + ,24 + ,32 + ,25 + ,33 + ,19 + ,1 + ,2 + ,21 + ,19 + ,25 + ,22 + ,16 + ,1 + ,2 + ,21 + ,21 + ,24 + ,27 + ,20 + ,1 + ,2 + ,22 + ,23 + ,29 + ,31 + ,18 + ,2 + ,1 + ,22 + ,26 + ,22 + ,40 + ,11 + ,1 + ,2 + ,21 + ,18 + ,23 + ,45 + ,18 + ,2 + ,1 + ,21 + ,19 + ,15 + ,33 + ,23 + ,1 + ,1 + ,22 + ,22 + ,29 + ,26 + ,19 + ,1 + ,2 + ,21 + ,27 + ,21 + ,28 + ,21 + ,2 + ,1 + ,21 + ,21 + ,23 + ,28 + ,16 + ,2 + ,1 + ,22 + ,20 + ,20 + ,30 + ,24 + ,2 + ,2 + ,21 + ,21 + ,25 + ,47 + ,23 + ,1 + ,1 + ,21 + ,20 + ,28 + ,30 + ,20 + ,1 + ,1 + ,21 + ,29 + ,18 + ,37 + ,23 + ,1 + ,1 + ,23 + ,30 + ,25 + ,23 + ,25 + ,1 + ,1 + ,22 + ,23 + ,24 + ,24 + ,24 + ,2 + ,1 + ,21 + ,29 + ,23 + ,15 + ,19 + ,1 + ,2 + ,22 + ,19 + ,25 + ,39 + ,15 + ,1 + ,1 + ,22 + ,26 + ,27 + ,32 + ,20 + ,1 + ,1 + ,22 + ,22 + ,24 + ,23 + ,14 + ,2 + ,1 + ,23 + ,26 + ,24 + ,41 + ,34 + ,2 + ,1 + ,24 + ,27 + ,26 + ,39 + ,24 + ,2 + ,1 + ,22 + ,19 + ,18 + ,42 + ,26 + ,2 + ,2 + ,21 + ,24 + ,26 + ,38 + ,23 + ,1 + ,2 + ,21 + ,26 + ,23 + ,30 + ,18 + ,2 + ,2 + ,22 + ,22 + ,28 + ,19 + ,11 + ,1 + ,1 + ,20 + ,23 + ,20 + ,45 + ,28 + ,1 + ,1 + ,23 + ,25 + ,23 + ,36 + ,15 + ,1 + ,2 + ,21 + ,19 + ,24 + ,36 + ,26 + ,1 + ,1 + ,22 + ,20 + ,21 + ,33 + ,20 + ,2 + ,1 + ,23 + ,25 + ,25 + ,35 + ,21 + ,2 + ,1 + ,21 + ,14 + ,16 + ,29 + ,21 + ,1 + ,2 + ,21 + ,20 + ,19 + ,28 + ,15 + ,1 + ,1 + ,23 + ,27 + ,22 + ,40 + ,30 + ,1 + ,2 + ,21 + ,21 + ,27 + ,28 + ,21 + ,1 + ,2 + ,21 + ,21 + ,24 + ,36 + ,12 + ,1 + ,2 + ,21 + ,14 + ,17 + ,28 + ,23 + ,2 + ,1 + ,23 + ,21 + ,21 + ,42 + ,30 + ,1 + ,1 + ,21 + ,23 + ,21 + ,27 + ,22 + ,2 + ,1 + ,22 + ,18 + ,19 + ,32 + ,21 + ,1 + ,2 + ,22 + ,20 + ,25 + ,27 + ,19 + ,1 + ,2 + ,21 + ,19 + ,24 + ,30 + ,22 + ,1 + ,2 + ,21 + ,15 + ,21 + ,31 + ,18 + ,1 + ,2 + ,24 + ,23 + ,26 + ,26 + ,16 + ,1 + ,1 + ,21 + ,26 + ,25 + ,47 + ,19 + ,1 + ,1 + ,21 + ,21 + ,25 + ,28 + ,20 + ,1 + ,2 + ,20 + ,13 + ,13 + ,31 + ,12 + ,2 + ,2 + ,21 + ,24 + ,25 + ,26 + ,21 + ,1 + ,2 + ,NA + ,17 + ,23 + ,27 + ,14 + ,1 + ,1 + ,24 + ,21 + ,26 + ,28 + ,23 + ,1 + ,1 + ,22 + ,28 + ,22 + ,44 + ,30 + ,1 + ,1 + ,22 + ,22 + ,20 + ,32 + ,21 + ,1 + ,1 + ,22 + ,25 + ,14 + ,25 + ,25 + ,1 + ,1 + ,22 + ,18 + ,23 + ,24 + ,13 + ,1 + ,1 + ,23 + ,27 + ,24 + ,45 + ,17 + ,1 + ,1 + ,22 + ,25 + ,21 + ,37 + ,24 + ,2 + ,1 + ,22 + ,21 + ,24 + ,25 + ,21) + ,dim=c(7 + ,152) + ,dimnames=list(c('Roken' + ,'Geslacht' + ,'Leeftijd' + ,'PS' + ,'O' + ,'CMD' + ,'PEC') + ,1:152)) > y <- array(NA,dim=c(7,152),dimnames=list(c('Roken','Geslacht','Leeftijd','PS','O','CMD','PEC'),1:152)) > for (i in 1:dim(x)[1]) + { + for (j in 1:dim(x)[2]) + { + y[i,j] <- as.numeric(x[i,j]) + } + } > par4 = 'yes' > par3 = '3' > par2 = 'none' > par1 = '4' > #'GNU S' R Code compiled by R2WASP v. 1.0.44 () > #Author: Dr. Ian E. Holliday > #To cite this work: Ian E. Holliday, 2009, YOUR SOFTWARE TITLE (vNUMBER) in Free Statistics Software (v$_version), Office for Research Development and Education, URL http://www.wessa.net/rwasp_YOURPAGE.wasp/ > #Source of accompanying publication: > #Technical description: > library(party) Loading required package: survival Loading required package: splines Loading required package: grid Loading required package: modeltools Loading required package: stats4 Loading required package: coin Loading required package: mvtnorm Loading required package: zoo Attaching package: 'zoo' The following object(s) are masked from package:base : as.Date.numeric Loading required package: sandwich Loading required package: strucchange Loading required package: vcd Loading required package: MASS Loading required package: colorspace > library(Hmisc) Attaching package: 'Hmisc' The following object(s) are masked from package:survival : untangle.specials The following object(s) are masked from package:base : format.pval, round.POSIXt, trunc.POSIXt, units > par1 <- as.numeric(par1) > par3 <- as.numeric(par3) > x <- data.frame(t(y)) > is.data.frame(x) [1] TRUE > x <- x[!is.na(x[,par1]),] > k <- length(x[1,]) > n <- length(x[,1]) > colnames(x)[par1] [1] "PS" > x[,par1] [1] 15 23 26 19 19 16 23 22 19 24 19 25 23 31 29 18 17 22 21 24 22 16 22 21 25 [26] 22 24 21 25 29 19 29 25 19 27 25 23 24 23 25 26 23 22 32 22 18 19 23 24 19 [51] 16 23 17 17 28 24 21 14 21 20 25 20 17 26 17 17 24 30 25 15 25 18 20 32 14 [76] 20 25 25 25 35 29 25 21 21 24 26 24 20 24 18 17 22 22 22 24 32 19 21 23 26 [101] 18 19 22 27 21 20 21 20 29 30 23 29 19 26 22 26 27 19 24 26 22 23 25 19 20 [126] 25 14 20 27 21 21 14 21 23 18 20 19 15 23 26 21 13 24 17 21 28 22 25 18 27 [151] 25 21 > if (par2 == 'kmeans') { + cl <- kmeans(x[,par1], par3) + print(cl) + clm <- matrix(cbind(cl$centers,1:par3),ncol=2) + clm <- clm[sort.list(clm[,1]),] + for (i in 1:par3) { + cl$cluster[cl$cluster==clm[i,2]] <- paste('C',i,sep='') + } + cl$cluster <- as.factor(cl$cluster) + print(cl$cluster) + x[,par1] <- cl$cluster + } > if (par2 == 'quantiles') { + x[,par1] <- cut2(x[,par1],g=par3) + } > if (par2 == 'hclust') { + hc <- hclust(dist(x[,par1])^2, 'cen') + print(hc) + memb <- cutree(hc, k = par3) + dum <- c(mean(x[memb==1,par1])) + for (i in 2:par3) { + dum <- c(dum, mean(x[memb==i,par1])) + } + hcm <- matrix(cbind(dum,1:par3),ncol=2) + hcm <- hcm[sort.list(hcm[,1]),] + for (i in 1:par3) { + memb[memb==hcm[i,2]] <- paste('C',i,sep='') + } + memb <- as.factor(memb) + print(memb) + x[,par1] <- memb + } > if (par2=='equal') { + ed <- cut(as.numeric(x[,par1]),par3,labels=paste('C',1:par3,sep='')) + x[,par1] <- as.factor(ed) + } > table(x[,par1]) 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 35 1 4 3 3 8 7 14 10 16 14 13 13 17 9 5 2 6 2 1 3 1 > colnames(x) [1] "Roken" "Geslacht" "Leeftijd" "PS" "O" "CMD" "PEC" > colnames(x)[par1] [1] "PS" > x[,par1] [1] 15 23 26 19 19 16 23 22 19 24 19 25 23 31 29 18 17 22 21 24 22 16 22 21 25 [26] 22 24 21 25 29 19 29 25 19 27 25 23 24 23 25 26 23 22 32 22 18 19 23 24 19 [51] 16 23 17 17 28 24 21 14 21 20 25 20 17 26 17 17 24 30 25 15 25 18 20 32 14 [76] 20 25 25 25 35 29 25 21 21 24 26 24 20 24 18 17 22 22 22 24 32 19 21 23 26 [101] 18 19 22 27 21 20 21 20 29 30 23 29 19 26 22 26 27 19 24 26 22 23 25 19 20 [126] 25 14 20 27 21 21 14 21 23 18 20 19 15 23 26 21 13 24 17 21 28 22 25 18 27 [151] 25 21 > if (par2 == 'none') { + m <- ctree(as.formula(paste(colnames(x)[par1],' ~ .',sep='')),data = x) + } > > #Note: the /var/www/html/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab > load(file="/var/www/html/rcomp/createtable") > > if (par2 != 'none') { + m <- ctree(as.formula(paste('as.factor(',colnames(x)[par1],') ~ .',sep='')),data = x) + if (par4=='yes') { + a<-table.start() + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'10-Fold Cross Validation',3+2*par3,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'',1,TRUE) + a<-table.element(a,'Prediction (training)',par3+1,TRUE) + a<-table.element(a,'Prediction (testing)',par3+1,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Actual',1,TRUE) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,paste('C',jjj,sep=''),1,TRUE) + a<-table.element(a,'CV',1,TRUE) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,paste('C',jjj,sep=''),1,TRUE) + a<-table.element(a,'CV',1,TRUE) + a<-table.row.end(a) + for (i in 1:10) { + ind <- sample(2, nrow(x), replace=T, prob=c(0.9,0.1)) + m.ct <- ctree(as.formula(paste('as.factor(',colnames(x)[par1],') ~ .',sep='')),data =x[ind==1,]) + if (i==1) { + m.ct.i.pred <- predict(m.ct, newdata=x[ind==1,]) + m.ct.i.actu <- x[ind==1,par1] + m.ct.x.pred <- predict(m.ct, newdata=x[ind==2,]) + m.ct.x.actu <- x[ind==2,par1] + } else { + m.ct.i.pred <- c(m.ct.i.pred,predict(m.ct, newdata=x[ind==1,])) + m.ct.i.actu <- c(m.ct.i.actu,x[ind==1,par1]) + m.ct.x.pred <- c(m.ct.x.pred,predict(m.ct, newdata=x[ind==2,])) + m.ct.x.actu <- c(m.ct.x.actu,x[ind==2,par1]) + } + } + print(m.ct.i.tab <- table(m.ct.i.actu,m.ct.i.pred)) + numer <- 0 + for (i in 1:par3) { + print(m.ct.i.tab[i,i] / sum(m.ct.i.tab[i,])) + numer <- numer + m.ct.i.tab[i,i] + } + print(m.ct.i.cp <- numer / sum(m.ct.i.tab)) + print(m.ct.x.tab <- table(m.ct.x.actu,m.ct.x.pred)) + numer <- 0 + for (i in 1:par3) { + print(m.ct.x.tab[i,i] / sum(m.ct.x.tab[i,])) + numer <- numer + m.ct.x.tab[i,i] + } + print(m.ct.x.cp <- numer / sum(m.ct.x.tab)) + for (i in 1:par3) { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,paste('C',i,sep=''),1,TRUE) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,m.ct.i.tab[i,jjj]) + a<-table.element(a,round(m.ct.i.tab[i,i]/sum(m.ct.i.tab[i,]),4)) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,m.ct.x.tab[i,jjj]) + a<-table.element(a,round(m.ct.x.tab[i,i]/sum(m.ct.x.tab[i,]),4)) + a<-table.row.end(a) + } + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Overall',1,TRUE) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,'-') + a<-table.element(a,round(m.ct.i.cp,4)) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,'-') + a<-table.element(a,round(m.ct.x.cp,4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.end(a) + table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/1kfkt1292358761.tab") + } + } > m Conditional inference tree with 3 terminal nodes Response: PS Inputs: Roken, Geslacht, Leeftijd, O, CMD, PEC Number of observations: 152 1) CMD <= 31; criterion = 1, statistic = 16.265 2) O <= 19; criterion = 0.999, statistic = 15.117 3)* weights = 14 2) O > 19 4)* weights = 66 1) CMD > 31 5)* weights = 72 > postscript(file="/var/www/html/rcomp/tmp/2kfkt1292358761.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > plot(m) > dev.off() null device 1 > postscript(file="/var/www/html/rcomp/tmp/3kfkt1292358761.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > plot(x[,par1] ~ as.factor(where(m)),main='Response by Terminal Node',xlab='Terminal Node',ylab='Response') > dev.off() null device 1 > if (par2 == 'none') { + forec <- predict(m) + result <- as.data.frame(cbind(x[,par1],forec,x[,par1]-forec)) + colnames(result) <- c('Actuals','Forecasts','Residuals') + print(result) + } Actuals Forecasts Residuals 1 15 17.28571 -2.2857143 2 23 23.77778 -0.7777778 3 26 23.77778 2.2222222 4 19 21.77273 -2.7727273 5 19 21.77273 -2.7727273 6 16 21.77273 -5.7727273 7 23 23.77778 -0.7777778 8 22 21.77273 0.2272727 9 19 23.77778 -4.7777778 10 24 21.77273 2.2272727 11 19 17.28571 1.7142857 12 25 23.77778 1.2222222 13 23 23.77778 -0.7777778 14 31 23.77778 7.2222222 15 29 23.77778 5.2222222 16 18 21.77273 -3.7727273 17 17 21.77273 -4.7727273 18 22 23.77778 -1.7777778 19 21 21.77273 -0.7727273 20 24 23.77778 0.2222222 21 22 21.77273 0.2272727 22 16 17.28571 -1.2857143 23 22 21.77273 0.2272727 24 21 21.77273 -0.7727273 25 25 21.77273 3.2272727 26 22 23.77778 -1.7777778 27 24 23.77778 0.2222222 28 21 23.77778 -2.7777778 29 25 23.77778 1.2222222 30 29 23.77778 5.2222222 31 19 21.77273 -2.7727273 32 29 23.77778 5.2222222 33 25 21.77273 3.2272727 34 19 23.77778 -4.7777778 35 27 21.77273 5.2272727 36 25 21.77273 3.2272727 37 23 21.77273 1.2272727 38 24 21.77273 2.2272727 39 23 23.77778 -0.7777778 40 25 21.77273 3.2272727 41 26 21.77273 4.2272727 42 23 23.77778 -0.7777778 43 22 23.77778 -1.7777778 44 32 23.77778 8.2222222 45 22 23.77778 -1.7777778 46 18 23.77778 -5.7777778 47 19 21.77273 -2.7727273 48 23 21.77273 1.2272727 49 24 21.77273 2.2272727 50 19 21.77273 -2.7727273 51 16 21.77273 -5.7727273 52 23 23.77778 -0.7777778 53 17 23.77778 -6.7777778 54 17 21.77273 -4.7727273 55 28 23.77778 4.2222222 56 24 21.77273 2.2272727 57 21 17.28571 3.7142857 58 14 17.28571 -3.2857143 59 21 23.77778 -2.7777778 60 20 21.77273 -1.7727273 61 25 21.77273 3.2272727 62 20 23.77778 -3.7777778 63 17 23.77778 -6.7777778 64 26 23.77778 2.2222222 65 17 21.77273 -4.7727273 66 17 23.77778 -6.7777778 67 24 21.77273 2.2272727 68 30 23.77778 6.2222222 69 25 23.77778 1.2222222 70 15 21.77273 -6.7727273 71 25 23.77778 1.2222222 72 18 23.77778 -5.7777778 73 20 23.77778 -3.7777778 74 32 23.77778 8.2222222 75 14 17.28571 -3.2857143 76 20 21.77273 -1.7727273 77 25 23.77778 1.2222222 78 25 21.77273 3.2272727 79 25 21.77273 3.2272727 80 35 23.77778 11.2222222 81 29 23.77778 5.2222222 82 25 23.77778 1.2222222 83 21 21.77273 -0.7727273 84 21 21.77273 -0.7727273 85 24 23.77778 0.2222222 86 26 21.77273 4.2272727 87 24 21.77273 2.2272727 88 20 23.77778 -3.7777778 89 24 21.77273 2.2272727 90 18 17.28571 0.7142857 91 17 17.28571 -0.2857143 92 22 23.77778 -1.7777778 93 22 23.77778 -1.7777778 94 22 17.28571 4.7142857 95 24 23.77778 0.2222222 96 32 23.77778 8.2222222 97 19 21.77273 -2.7727273 98 21 21.77273 -0.7727273 99 23 21.77273 1.2272727 100 26 23.77778 2.2222222 101 18 23.77778 -5.7777778 102 19 23.77778 -4.7777778 103 22 21.77273 0.2272727 104 27 21.77273 5.2272727 105 21 21.77273 -0.7727273 106 20 21.77273 -1.7727273 107 21 23.77778 -2.7777778 108 20 21.77273 -1.7727273 109 29 23.77778 5.2222222 110 30 21.77273 8.2272727 111 23 21.77273 1.2272727 112 29 21.77273 7.2272727 113 19 23.77778 -4.7777778 114 26 23.77778 2.2222222 115 22 21.77273 0.2272727 116 26 23.77778 2.2222222 117 27 23.77778 3.2222222 118 19 23.77778 -4.7777778 119 24 23.77778 0.2222222 120 26 21.77273 4.2272727 121 22 21.77273 0.2272727 122 23 23.77778 -0.7777778 123 25 23.77778 1.2222222 124 19 23.77778 -4.7777778 125 20 23.77778 -3.7777778 126 25 23.77778 1.2222222 127 14 17.28571 -3.2857143 128 20 17.28571 2.7142857 129 27 23.77778 3.2222222 130 21 21.77273 -0.7727273 131 21 23.77778 -2.7777778 132 14 17.28571 -3.2857143 133 21 23.77778 -2.7777778 134 23 21.77273 1.2272727 135 18 23.77778 -5.7777778 136 20 21.77273 -1.7727273 137 19 21.77273 -2.7727273 138 15 21.77273 -6.7727273 139 23 21.77273 1.2272727 140 26 23.77778 2.2222222 141 21 21.77273 -0.7727273 142 13 17.28571 -4.2857143 143 24 21.77273 2.2272727 144 17 21.77273 -4.7727273 145 21 21.77273 -0.7727273 146 28 23.77778 4.2222222 147 22 23.77778 -1.7777778 148 25 17.28571 7.7142857 149 18 21.77273 -3.7727273 150 27 23.77778 3.2222222 151 25 23.77778 1.2222222 152 21 21.77273 -0.7727273 > if (par2 != 'none') { + print(cbind(as.factor(x[,par1]),predict(m))) + myt <- table(as.factor(x[,par1]),predict(m)) + print(myt) + } > postscript(file="/var/www/html/rcomp/tmp/4doke1292358761.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > if(par2=='none') { + op <- par(mfrow=c(2,2)) + plot(density(result$Actuals),main='Kernel Density Plot of Actuals') + plot(density(result$Residuals),main='Kernel Density Plot of Residuals') + plot(result$Forecasts,result$Actuals,main='Actuals versus Predictions',xlab='Predictions',ylab='Actuals') + plot(density(result$Forecasts),main='Kernel Density Plot of Predictions') + par(op) + } > if(par2!='none') { + plot(myt,main='Confusion Matrix',xlab='Actual',ylab='Predicted') + } > dev.off() null device 1 > if (par2 == 'none') { + detcoef <- cor(result$Forecasts,result$Actuals) + a<-table.start() + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Goodness of Fit',2,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Correlation',1,TRUE) + a<-table.element(a,round(detcoef,4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'R-squared',1,TRUE) + a<-table.element(a,round(detcoef*detcoef,4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'RMSE',1,TRUE) + a<-table.element(a,round(sqrt(mean((result$Residuals)^2)),4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.end(a) + table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/5rghn1292358761.tab") + a<-table.start() + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Actuals, Predictions, and Residuals',4,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'#',header=TRUE) + a<-table.element(a,'Actuals',header=TRUE) + a<-table.element(a,'Forecasts',header=TRUE) + a<-table.element(a,'Residuals',header=TRUE) + a<-table.row.end(a) + for (i in 1:length(result$Actuals)) { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,i,header=TRUE) + a<-table.element(a,result$Actuals[i]) + a<-table.element(a,result$Forecasts[i]) + a<-table.element(a,result$Residuals[i]) + a<-table.row.end(a) + } + a<-table.end(a) + table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/6kpzq1292358761.tab") + } > if (par2 != 'none') { + a<-table.start() + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Confusion Matrix (predicted in columns / actuals in rows)',par3+1,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'',1,TRUE) + for (i in 1:par3) { + a<-table.element(a,paste('C',i,sep=''),1,TRUE) + } + a<-table.row.end(a) + for (i in 1:par3) { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,paste('C',i,sep=''),1,TRUE) + for (j in 1:par3) { + a<-table.element(a,myt[i,j]) + } + a<-table.row.end(a) + } + a<-table.end(a) + table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/758xe1292358761.tab") + } > > try(system("convert tmp/2kfkt1292358761.ps tmp/2kfkt1292358761.png",intern=TRUE)) character(0) > try(system("convert tmp/3kfkt1292358761.ps tmp/3kfkt1292358761.png",intern=TRUE)) character(0) > try(system("convert tmp/4doke1292358761.ps tmp/4doke1292358761.png",intern=TRUE)) character(0) > > > proc.time() user system elapsed 2.905 0.581 6.385