R version 2.9.0 (2009-04-17)
Copyright (C) 2009 The R Foundation for Statistical Computing
ISBN 3-900051-07-0

R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
You are welcome to redistribute it under certain conditions.
Type 'license()' or 'licence()' for distribution details.

R is a collaborative project with many contributors.
Type 'contributors()' for more information and
'citation()' on how to cite R or R packages in publications.

Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.

> x <- array(list(2
+ ,73
+ ,69
+ ,1
+ ,58
+ ,53
+ ,1
+ ,68
+ ,43
+ ,2
+ ,69
+ ,60
+ ,1
+ ,62
+ ,49
+ ,1
+ ,68
+ ,62
+ ,1
+ ,65
+ ,45
+ ,1
+ ,65
+ ,50
+ ,1
+ ,81
+ ,75
+ ,1
+ ,73
+ ,82
+ ,2
+ ,64
+ ,60
+ ,1
+ ,68
+ ,59
+ ,1
+ ,51
+ ,21
+ ,1
+ ,68
+ ,40
+ ,1
+ ,61
+ ,62
+ ,2
+ ,77
+ ,54
+ ,1
+ ,69
+ ,47
+ ,1
+ ,73
+ ,59
+ ,2
+ ,61
+ ,37
+ ,2
+ ,62
+ ,43
+ ,1
+ ,63
+ ,48
+ ,1
+ ,69
+ ,59
+ ,2
+ ,47
+ ,79
+ ,2
+ ,66
+ ,62
+ ,1
+ ,58
+ ,16
+ ,2
+ ,63
+ ,38
+ ,1
+ ,69
+ ,58
+ ,2
+ ,59
+ ,60
+ ,1
+ ,59
+ ,72
+ ,2
+ ,63
+ ,67
+ ,2
+ ,65
+ ,55
+ ,1
+ ,65
+ ,47
+ ,2
+ ,71
+ ,59
+ ,1
+ ,60
+ ,49
+ ,2
+ ,66
+ ,47
+ ,1
+ ,67
+ ,57
+ ,2
+ ,81
+ ,39
+ ,1
+ ,62
+ ,49
+ ,1
+ ,63
+ ,26
+ ,2
+ ,73
+ ,53
+ ,2
+ ,55
+ ,75
+ ,1
+ ,59
+ ,65
+ ,1
+ ,64
+ ,49
+ ,2
+ ,63
+ ,48
+ ,2
+ ,74
+ ,45
+ ,2
+ ,67
+ ,31
+ ,1
+ ,64
+ ,67
+ ,1
+ ,73
+ ,61
+ ,1
+ ,54
+ ,49
+ ,1
+ ,76
+ ,69
+ ,2
+ ,74
+ ,54
+ ,2
+ ,63
+ ,80
+ ,2
+ ,73
+ ,57
+ ,2
+ ,67
+ ,34
+ ,2
+ ,68
+ ,69
+ ,1
+ ,66
+ ,44
+ ,2
+ ,62
+ ,70
+ ,2
+ ,71
+ ,51
+ ,1
+ ,68
+ ,66
+ ,1
+ ,63
+ ,18
+ ,1
+ ,75
+ ,74
+ ,1
+ ,77
+ ,59
+ ,2
+ ,62
+ ,48
+ ,1
+ ,74
+ ,55
+ ,2
+ ,67
+ ,44
+ ,2
+ ,56
+ ,56
+ ,2
+ ,60
+ ,65
+ ,2
+ ,58
+ ,77
+ ,1
+ ,65
+ ,46
+ ,2
+ ,49
+ ,70
+ ,1
+ ,61
+ ,39
+ ,2
+ ,66
+ ,55
+ ,2
+ ,64
+ ,44
+ ,2
+ ,65
+ ,45
+ ,1
+ ,46
+ ,45
+ ,2
+ ,81
+ ,25
+ ,2
+ ,65
+ ,49
+ ,1
+ ,72
+ ,65
+ ,2
+ ,65
+ ,45
+ ,2
+ ,74
+ ,71
+ ,1
+ ,69
+ ,48
+ ,1
+ ,59
+ ,41
+ ,2
+ ,58
+ ,40
+ ,1
+ ,71
+ ,64
+ ,2
+ ,79
+ ,56
+ ,2
+ ,68
+ ,52
+ ,1
+ ,66
+ ,41
+ ,2
+ ,62
+ ,45
+ ,1
+ ,69
+ ,49
+ ,1
+ ,60
+ ,42
+ ,2
+ ,63
+ ,54
+ ,1
+ ,62
+ ,40
+ ,1
+ ,61
+ ,40
+ ,2
+ ,65
+ ,51
+ ,1
+ ,64
+ ,48
+ ,2
+ ,67
+ ,80
+ ,2
+ ,56
+ ,38
+ ,2
+ ,56
+ ,57
+ ,1
+ ,48
+ ,28
+ ,1
+ ,74
+ ,51
+ ,1
+ ,69
+ ,46
+ ,1
+ ,62
+ ,58
+ ,1
+ ,73
+ ,67
+ ,1
+ ,64
+ ,72
+ ,1
+ ,57
+ ,26
+ ,1
+ ,57
+ ,54
+ ,2
+ ,60
+ ,53
+ ,2
+ ,61
+ ,69
+ ,1
+ ,72
+ ,64
+ ,1
+ ,57
+ ,47
+ ,1
+ ,51
+ ,43
+ ,1
+ ,63
+ ,66
+ ,1
+ ,54
+ ,54
+ ,1
+ ,72
+ ,62
+ ,1
+ ,62
+ ,52
+ ,1
+ ,68
+ ,64
+ ,1
+ ,62
+ ,55
+ ,2
+ ,63
+ ,57
+ ,1
+ ,77
+ ,74
+ ,1
+ ,57
+ ,32
+ ,1
+ ,57
+ ,38
+ ,1
+ ,61
+ ,66
+ ,2
+ ,66
+ ,37
+ ,1
+ ,65
+ ,26
+ ,1
+ ,63
+ ,64
+ ,1
+ ,59
+ ,28
+ ,2
+ ,66
+ ,66
+ ,1
+ ,68
+ ,65
+ ,1
+ ,72
+ ,48
+ ,1
+ ,68
+ ,44
+ ,2
+ ,68
+ ,64
+ ,1
+ ,67
+ ,39
+ ,1
+ ,59
+ ,50
+ ,1
+ ,56
+ ,52
+ ,1
+ ,62
+ ,66
+ ,2
+ ,55
+ ,48
+ ,2
+ ,72
+ ,70
+ ,2
+ ,68
+ ,66
+ ,1
+ ,67
+ ,61
+ ,1
+ ,54
+ ,31
+ ,2
+ ,69
+ ,61
+ ,1
+ ,61
+ ,54
+ ,1
+ ,55
+ ,34
+ ,2
+ ,75
+ ,62
+ ,1
+ ,55
+ ,47
+ ,1
+ ,49
+ ,52
+ ,2
+ ,54
+ ,37
+ ,1
+ ,51
+ ,46
+ ,1
+ ,66
+ ,50
+ ,1
+ ,73
+ ,61
+ ,2
+ ,63
+ ,70
+ ,2
+ ,61
+ ,38
+ ,1
+ ,74
+ ,63
+ ,2
+ ,81
+ ,34
+ ,1
+ ,58
+ ,46
+ ,1
+ ,62
+ ,40
+ ,1
+ ,64
+ ,30
+ ,1
+ ,62
+ ,35
+ ,1
+ ,85
+ ,51
+ ,1
+ ,74
+ ,56
+ ,1
+ ,51
+ ,68
+ ,1
+ ,66
+ ,39
+ ,2
+ ,61
+ ,44
+ ,1
+ ,72
+ ,58)
+ ,dim=c(3
+ ,164)
+ ,dimnames=list(c('gender'
+ ,'nonverbal'
+ ,'anxiety')
+ ,1:164))
>  y <- array(NA,dim=c(3,164),dimnames=list(c('gender','nonverbal','anxiety'),1:164))
>  for (i in 1:dim(x)[1])
+  {
+  	for (j in 1:dim(x)[2])
+  	{
+  		y[i,j] <- as.numeric(x[i,j])
+  	}
+  }
> par1 = 'pearson'
> main = 'Correlation Matrix'
> par1 <- 'pearson'
> #'GNU S' R Code compiled by R2WASP v. 1.0.44 ()
> #Author: Dr. Ian E. Holliday
> #To cite this work: Ian E. Holliday, 2009, YOUR SOFTWARE TITLE (vNUMBER) in Free Statistics Software (v$_version), Office for Research Development and Education, URL http://www.wessa.net/rwasp_YOURPAGE.wasp/
> #Source of accompanying publication: 
> #Technical description: 
> panel.tau <- function(x, y, digits=2, prefix='', cex.cor)
+ {
+ usr <- par('usr'); on.exit(par(usr))
+ par(usr = c(0, 1, 0, 1))
+ rr <- cor.test(x, y, method=par1)
+ r <- round(rr$p.value,2)
+ txt <- format(c(r, 0.123456789), digits=digits)[1]
+ txt <- paste(prefix, txt, sep='')
+ if(missing(cex.cor)) cex <- 0.5/strwidth(txt)
+ text(0.5, 0.5, txt, cex = cex)
+ }
> panel.hist <- function(x, ...)
+ {
+ usr <- par('usr'); on.exit(par(usr))
+ par(usr = c(usr[1:2], 0, 1.5) )
+ h <- hist(x, plot = FALSE)
+ breaks <- h$breaks; nB <- length(breaks)
+ y <- h$counts; y <- y/max(y)
+ rect(breaks[-nB], 0, breaks[-1], y, col='grey', ...)
+ }
> postscript(file="/var/www/html/rcomp/tmp/1ixif1292346464.ps",horizontal=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) 
> pairs(t(y),diag.panel=panel.hist, upper.panel=panel.smooth, lower.panel=panel.tau, main=main)
> dev.off()
null device 
          1 
> 
> #Note: the /var/www/html/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab
> load(file="/var/www/html/rcomp/createtable")
> 
> n <- length(y[,1])
> n
[1] 3
> a<-table.start()
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,paste('Correlations for all pairs of data series (method=',par1,')',sep=''),n+1,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,' ',header=TRUE)
> for (i in 1:n) {
+ a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],header=TRUE)
+ }
> a<-table.row.end(a)
> for (i in 1:n) {
+ a<-table.row.start(a)
+ a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],header=TRUE)
+ for (j in 1:n) {
+ r <- cor.test(y[i,],y[j,],method=par1)
+ a<-table.element(a,round(r$estimate,3))
+ }
+ a<-table.row.end(a)
+ }
> a<-table.end(a)
> table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/2x6f61292346464.tab") 
> a<-table.start()
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Correlations for all pairs of data series with p-values',4,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'pair',1,TRUE)
> a<-table.element(a,'Pearson r',1,TRUE)
> a<-table.element(a,'Spearman rho',1,TRUE)
> a<-table.element(a,'Kendall tau',1,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> cor.test(y[1,],y[2,],method=par1)

	Pearson's product-moment correlation

data:  y[1, ] and y[2, ] 
t = 0.9391, df = 162, p-value = 0.3491
alternative hypothesis: true correlation is not equal to 0 
95 percent confidence interval:
 -0.0805778  0.2243013 
sample estimates:
      cor 
0.0735807 

> for (i in 1:(n-1))
+ {
+ for (j in (i+1):n)
+ {
+ a<-table.row.start(a)
+ dum <- paste(dimnames(t(x))[[2]][i],';',dimnames(t(x))[[2]][j],sep='')
+ a<-table.element(a,dum,header=TRUE)
+ rp <- cor.test(y[i,],y[j,],method='pearson')
+ a<-table.element(a,round(rp$estimate,4))
+ rs <- cor.test(y[i,],y[j,],method='spearman')
+ a<-table.element(a,round(rs$estimate,4))
+ rk <- cor.test(y[i,],y[j,],method='kendall')
+ a<-table.element(a,round(rk$estimate,4))
+ a<-table.row.end(a)
+ a<-table.row.start(a)
+ a<-table.element(a,'p-value',header=T)
+ a<-table.element(a,paste('(',round(rp$p.value,4),')',sep=''))
+ a<-table.element(a,paste('(',round(rs$p.value,4),')',sep=''))
+ a<-table.element(a,paste('(',round(rk$p.value,4),')',sep=''))
+ a<-table.row.end(a)
+ }
+ }
Warning messages:
1: In cor.test.default(y[i, ], y[j, ], method = "spearman") :
  Cannot compute exact p-values with ties
2: In cor.test.default(y[i, ], y[j, ], method = "spearman") :
  Cannot compute exact p-values with ties
3: In cor.test.default(y[i, ], y[j, ], method = "spearman") :
  Cannot compute exact p-values with ties
> a<-table.end(a)
> table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/3szh71292346465.tab") 
> 
> try(system("convert tmp/1ixif1292346464.ps tmp/1ixif1292346464.png",intern=TRUE))
character(0)
> 
> 
> proc.time()
   user  system elapsed 
  0.525   0.228   1.609