R version 2.9.0 (2009-04-17) Copyright (C) 2009 The R Foundation for Statistical Computing ISBN 3-900051-07-0 R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. You are welcome to redistribute it under certain conditions. Type 'license()' or 'licence()' for distribution details. R is a collaborative project with many contributors. Type 'contributors()' for more information and 'citation()' on how to cite R or R packages in publications. Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or 'help.start()' for an HTML browser interface to help. Type 'q()' to quit R. > x <- array(list(10 + ,11 + ,16 + ,1 + ,24 + ,14 + ,33 + ,12 + ,24 + ,14 + ,11 + ,13 + ,2 + ,25 + ,11 + ,30 + ,8 + ,25 + ,18 + ,15 + ,16 + ,2 + ,17 + ,6 + ,30 + ,8 + ,30 + ,15 + ,9 + ,15 + ,1 + ,18 + ,12 + ,26 + ,8 + ,19 + ,11 + ,17 + ,15 + ,2 + ,16 + ,10 + ,24 + ,7 + ,22 + ,17 + ,16 + ,14 + ,2 + ,20 + ,10 + ,28 + ,4 + ,25 + ,19 + ,9 + ,11 + ,2 + ,16 + ,11 + ,24 + ,11 + ,23 + ,7 + ,12 + ,15 + ,2 + ,18 + ,16 + ,27 + ,7 + ,17 + ,12 + ,14 + ,13 + ,2 + ,17 + ,11 + ,28 + ,7 + ,21 + ,15 + ,4 + ,6 + ,2 + ,30 + ,12 + ,42 + ,10 + ,19 + ,14 + ,13 + ,11 + ,2 + ,23 + ,8 + ,31 + ,10 + ,15 + ,14 + ,12 + ,9 + ,2 + ,18 + ,12 + ,25 + ,8 + ,16 + ,16 + ,13 + ,14 + ,1 + ,12 + ,4 + ,23 + ,4 + ,27 + ,12 + ,15 + ,5 + ,2 + ,21 + ,9 + ,27 + ,9 + ,22 + ,12 + ,10 + ,8 + ,1 + ,15 + ,8 + ,23 + ,8 + ,14 + ,13 + ,9 + ,6 + ,1 + ,20 + ,8 + ,34 + ,7 + ,22 + ,9 + ,11 + ,15 + ,2 + ,27 + ,15 + ,36 + ,9 + ,23 + ,11 + ,15 + ,12 + ,2 + ,21 + ,9 + ,31 + ,13 + ,19 + ,12 + ,10 + ,10 + ,1 + ,31 + ,14 + ,39 + ,8 + ,18 + ,11 + ,9 + ,8 + ,1 + ,19 + ,11 + ,27 + ,8 + ,20 + ,14 + ,15 + ,16 + ,2 + ,16 + ,8 + ,27 + ,9 + ,23 + ,18 + ,12 + ,8 + ,2 + ,20 + ,9 + ,31 + ,6 + ,25 + ,11 + ,12 + ,12 + ,1 + ,21 + ,9 + ,31 + ,9 + ,19 + ,17 + ,14 + ,14 + ,2 + ,17 + ,9 + ,26 + ,6 + ,22 + ,14 + ,16 + ,13 + ,1 + ,22 + ,9 + ,34 + ,9 + ,24 + ,14 + ,5 + ,8 + ,2 + ,26 + ,11 + ,39 + ,5 + ,29 + ,12 + ,10 + ,11 + ,2 + ,25 + ,16 + ,39 + ,16 + ,26 + ,14 + ,9 + ,12 + ,2 + ,25 + ,8 + ,35 + ,7 + ,32 + ,15 + ,14 + ,13 + ,2 + ,17 + ,9 + ,30 + ,9 + ,25 + ,10 + ,5 + ,4 + ,1 + ,33 + ,14 + ,40 + ,6 + ,32 + ,11 + ,12 + ,16 + ,1 + ,32 + ,16 + ,38 + ,6 + ,29 + ,14 + ,14 + ,17 + ,1 + ,13 + ,16 + ,21 + ,5 + ,17 + ,11 + ,16 + ,14 + ,2 + ,32 + ,12 + ,45 + ,12 + ,28 + ,15 + ,11 + ,8 + ,2 + ,22 + ,9 + ,32 + ,9 + ,25 + ,16 + ,6 + ,6 + ,2 + ,17 + ,9 + ,29 + ,5 + ,25 + ,15 + ,11 + ,15 + ,1 + ,33 + ,11 + ,40 + ,6 + ,28 + ,16 + ,9 + ,11 + ,2 + ,31 + ,14 + ,44 + ,11 + ,23 + ,13 + ,16 + ,16 + ,1 + ,20 + ,10 + ,28 + ,8 + ,26 + ,15 + ,13 + ,5 + ,1 + ,15 + ,12 + ,24 + ,8 + ,20 + ,16 + ,10 + ,5 + ,2 + ,29 + ,10 + ,37 + ,8 + ,25 + ,13 + ,6 + ,9 + ,1 + ,23 + ,13 + ,33 + ,12 + ,19 + ,9 + ,12 + ,7 + ,1 + ,26 + ,16 + ,30 + ,4 + ,23 + ,14 + ,15 + ,14 + ,1 + ,18 + ,9 + ,26 + ,8 + ,21 + ,15 + ,15 + ,12 + ,2 + ,11 + ,6 + ,16 + ,4 + ,15 + ,14 + ,11 + ,7 + ,1 + ,28 + ,8 + ,48 + ,20 + ,30 + ,16 + ,16 + ,16 + ,2 + ,20 + ,10 + ,30 + ,8 + ,20 + ,13 + ,12 + ,10 + ,2 + ,26 + ,13 + ,35 + ,8 + ,24 + ,17 + ,11 + ,8 + ,1 + ,29 + ,14 + ,43 + ,10 + ,26 + ,16 + ,14 + ,15 + ,1 + ,15 + ,11 + ,22 + ,8 + ,23 + ,15 + ,7 + ,8 + ,1 + ,12 + ,7 + ,16 + ,4 + ,22 + ,16 + ,11 + ,12 + ,2 + ,14 + ,15 + ,25 + ,8 + ,14 + ,15 + ,13 + ,14 + ,1 + ,17 + ,9 + ,27 + ,9 + ,24 + ,13 + ,16 + ,16 + ,1 + ,21 + ,10 + ,31 + ,6 + ,24 + ,11 + ,17 + ,15 + ,2 + ,16 + ,10 + ,24 + ,7 + ,22 + ,16 + ,12 + ,14 + ,1 + ,18 + ,13 + ,25 + ,9 + ,24 + ,17 + ,14 + ,16 + ,1 + ,10 + ,10 + ,18 + ,5 + ,19 + ,10 + ,6 + ,15 + ,1 + ,29 + ,11 + ,36 + ,5 + ,31 + ,17 + ,8 + ,7 + ,1 + ,31 + ,8 + ,39 + ,8 + ,22 + ,11 + ,8 + ,10 + ,1 + ,19 + ,9 + ,29 + ,8 + ,27 + ,14 + ,14 + ,13 + ,1 + ,9 + ,13 + ,16 + ,6 + ,19 + ,15 + ,12 + ,13 + ,2 + ,20 + ,11 + ,29 + ,8 + ,25 + ,11 + ,13 + ,8 + ,2 + ,20 + ,14 + ,30 + ,10 + ,18 + ,15 + ,9 + ,6 + ,2 + ,19 + ,9 + ,26 + ,7 + ,21 + ,16 + ,12 + ,6 + ,2 + ,30 + ,9 + ,41 + ,9 + ,27 + ,16 + ,13 + ,14 + ,2 + ,28 + ,8 + ,37 + ,7 + ,20 + ,15 + ,15 + ,16 + ,2 + ,29 + ,15 + ,43 + ,11 + ,23 + ,14 + ,11 + ,11 + ,2 + ,26 + ,9 + ,37 + ,6 + ,25 + ,17 + ,14 + ,15 + ,2 + ,23 + ,10 + ,33 + ,8 + ,20 + ,12 + ,16 + ,12 + ,2 + ,21 + ,12 + ,31 + ,9 + ,22 + ,13 + ,14 + ,8 + ,2 + ,23 + ,14 + ,36 + ,7 + ,25 + ,12 + ,8 + ,8 + ,1 + ,19 + ,12 + ,26 + ,8 + ,23 + ,9 + ,16 + ,16 + ,2 + ,28 + ,11 + ,37 + ,6 + ,25 + ,17 + ,13 + ,14 + ,2 + ,18 + ,6 + ,26 + ,8 + ,17 + ,11 + ,4 + ,4 + ,1 + ,21 + ,12 + ,31 + ,8 + ,19 + ,16 + ,11 + ,5 + ,2 + ,20 + ,8 + ,32 + ,10 + ,25 + ,14 + ,16 + ,16 + ,2 + ,22 + ,10 + ,32 + ,8 + ,26 + ,9 + ,8 + ,9 + ,1 + ,23 + ,14 + ,29 + ,5 + ,19 + ,15 + ,14 + ,15 + ,1 + ,21 + ,11 + ,33 + ,7 + ,20 + ,17 + ,16 + ,14 + ,2 + ,20 + ,10 + ,28 + ,4 + ,25 + ,17 + ,12 + ,7 + ,1 + ,15 + ,14 + ,22 + ,8 + ,23 + ,15 + ,16 + ,15 + ,1 + ,19 + ,10 + ,28 + ,7 + ,17 + ,18 + ,7 + ,12 + ,1 + ,26 + ,14 + ,36 + ,8 + ,17 + ,13 + ,14 + ,15 + ,1 + ,16 + ,11 + ,23 + ,5 + ,17 + ,15 + ,13 + ,11 + ,2 + ,22 + ,10 + ,34 + ,6 + ,22 + ,12 + ,12 + ,10 + ,2 + ,23 + ,14 + ,34 + ,10 + ,25 + ,16 + ,7 + ,7 + ,1 + ,19 + ,9 + ,27 + ,10 + ,21 + ,17 + ,14 + ,19 + ,2 + ,31 + ,10 + ,47 + ,12 + ,32 + ,13 + ,14 + ,13 + ,2 + ,29 + ,13 + ,44 + ,12 + ,21 + ,15 + ,11 + ,11 + ,1 + ,31 + ,16 + ,43 + ,9 + ,21 + ,12 + ,14 + ,13 + ,1 + ,19 + ,9 + ,27 + ,7 + ,18 + ,11 + ,13 + ,12 + ,2 + ,22 + ,10 + ,32 + ,8 + ,18 + ,15 + ,15 + ,13 + ,2 + ,23 + ,10 + ,34 + ,10 + ,23 + ,15 + ,12 + ,11 + ,1 + ,15 + ,7 + ,24 + ,6 + ,19 + ,18 + ,14 + ,10 + ,2 + ,18 + ,8 + ,31 + ,10 + ,21 + ,16 + ,14 + ,14 + ,1 + ,23 + ,14 + ,31 + ,10 + ,20 + ,12 + ,16 + ,14 + ,2 + ,25 + ,14 + ,34 + ,5 + ,17 + ,16 + ,12 + ,7 + ,2 + ,21 + ,8 + ,28 + ,7 + ,18 + ,15 + ,16 + ,14 + ,2 + ,24 + ,9 + ,35 + ,10 + ,19 + ,15 + ,11 + ,14 + ,1 + ,17 + ,14 + ,27 + ,6 + ,15 + ,17 + ,10 + ,13 + ,2 + ,13 + ,8 + ,21 + ,7 + ,14 + ,16 + ,11 + ,7 + ,2 + ,25 + ,7 + ,38 + ,11 + ,35 + ,13 + ,12 + ,14 + ,2 + ,9 + ,6 + ,15 + ,11 + ,29 + ,13 + ,13 + ,7 + ,1 + ,21 + ,8 + ,29 + ,11 + ,24 + ,13 + ,14 + ,12 + ,1 + ,25 + ,14 + ,35 + ,9 + ,22 + ,16 + ,11 + ,14 + ,1 + ,20 + ,11 + ,25 + ,4 + ,13 + ,11 + ,11 + ,10 + ,2 + ,22 + ,14 + ,33 + ,11 + ,25 + ,15 + ,12 + ,12 + ,2 + ,14 + ,11 + ,23 + ,7 + ,17 + ,15 + ,15 + ,15 + ,2 + ,15 + ,8 + ,19 + ,6 + ,20 + ,9 + ,10 + ,9 + ,1 + ,18 + ,10 + ,30 + ,8 + ,14 + ,14 + ,12 + ,12 + ,1 + ,19 + ,20 + ,25 + ,7 + ,19 + ,14 + ,8 + ,8 + ,1 + ,20 + ,11 + ,33 + ,8 + ,21 + ,15 + ,15 + ,14 + ,2 + ,20 + ,11 + ,28 + ,8 + ,24 + ,14 + ,13 + ,13 + ,2 + ,18 + ,10 + ,29 + ,9 + ,21 + ,15 + ,12 + ,14 + ,2 + ,33 + ,14 + ,41 + ,8 + ,26 + ,14 + ,12 + ,14 + ,2 + ,29 + ,11 + ,33 + ,4 + ,26 + ,13 + ,10 + ,4 + ,2 + ,22 + ,11 + ,31 + ,11 + ,24 + ,15 + ,11 + ,12 + ,2 + ,16 + ,9 + ,25 + ,8 + ,16 + ,16 + ,10 + ,15 + ,1 + ,17 + ,9 + ,24 + ,5 + ,23 + ,14 + ,8 + ,10 + ,1 + ,21 + ,10 + ,31 + ,8 + ,16 + ,14 + ,8 + ,10 + ,2 + ,18 + ,13 + ,28 + ,6 + ,19 + ,14 + ,12 + ,11 + ,2 + ,18 + ,12 + ,27 + ,9 + ,21 + ,15 + ,9 + ,15 + ,1 + ,18 + ,12 + ,26 + ,8 + ,19 + ,15 + ,15 + ,12 + ,2 + ,17 + ,8 + ,26 + ,9 + ,21 + ,13 + ,16 + ,15 + ,2 + ,22 + ,13 + ,31 + ,13 + ,22 + ,15 + ,13 + ,16 + ,2 + ,30 + ,14 + ,37 + ,9 + ,23 + ,16 + ,7 + ,13 + ,2 + ,30 + ,12 + ,43 + ,10 + ,29 + ,10 + ,8 + ,4 + ,2 + ,24 + ,14 + ,43 + ,20 + ,21 + ,8 + ,8 + ,10 + ,1 + ,21 + ,15 + ,26 + ,5 + ,21 + ,14 + ,9 + ,11 + ,2 + ,29 + ,16 + ,37 + ,6 + ,27 + ,12 + ,16 + ,8 + ,2 + ,28 + ,12 + ,40 + ,14 + ,27 + ,13 + ,16 + ,15 + ,2 + ,31 + ,9 + ,45 + ,9 + ,25 + ,15 + ,9 + ,9 + ,2 + ,20 + ,9 + ,28 + ,7 + ,21 + ,14 + ,8 + ,9 + ,2 + ,22 + ,8 + ,32 + ,10 + ,20 + ,15 + ,14 + ,10 + ,2 + ,25 + ,14 + ,36 + ,11 + ,22 + ,19 + ,16 + ,14 + ,2 + ,20 + ,7 + ,27 + ,9 + ,26 + ,17 + ,12 + ,15 + ,2 + ,15 + ,8 + ,21 + ,4 + ,22 + ,16 + ,10 + ,8 + ,2 + ,38 + ,11 + ,55 + ,7 + ,29 + ,17 + ,10 + ,8 + ,2 + ,28 + ,16 + ,40 + ,8 + ,24 + ,13 + ,12 + ,11 + ,2 + ,16 + ,8 + ,26 + ,5 + ,21 + ,16 + ,19 + ,15 + ,2 + ,22 + ,9 + ,32 + ,6 + ,19 + ,14 + ,12 + ,15 + ,2 + ,20 + ,11 + ,35 + ,13 + ,24 + ,12 + ,15 + ,13 + ,1 + ,26 + ,13 + ,42 + ,10 + ,26 + ,12 + ,15 + ,5 + ,2 + ,21 + ,9 + ,27 + ,9 + ,22 + ,13 + ,15 + ,17 + ,1 + ,28 + ,14 + ,36 + ,8 + ,24) + ,dim=c(9 + ,144) + ,dimnames=list(c('Happiness' + ,'Popularity' + ,'KnowPeople' + ,'Gender' + ,'CMistakes' + ,'DAction' + ,'PExpectations' + ,'PCriticism' + ,'PStandards') + ,1:144)) > y <- array(NA,dim=c(9,144),dimnames=list(c('Happiness','Popularity','KnowPeople','Gender','CMistakes','DAction','PExpectations','PCriticism','PStandards'),1:144)) > for (i in 1:dim(x)[1]) + { + for (j in 1:dim(x)[2]) + { + y[i,j] <- as.numeric(x[i,j]) + } + } > par1 = 'kendall' > main = 'Correlation Matrix' > par1 <- 'pearson' > #'GNU S' R Code compiled by R2WASP v. 1.0.44 () > #Author: Patrick Wessa > #To cite this work: Patrick Wessa, (2010), Multivariate Correlation Matrix (v1.0.4) in Free Statistics Software (v$_version), Office for Research Development and Education, URL http://www.wessa.net/Patrick.Wessa/rwasp_pairs.wasp/ > #Source of accompanying publication: > #Technical description: > panel.tau <- function(x, y, digits=2, prefix='', cex.cor) + { + usr <- par('usr'); on.exit(par(usr)) + par(usr = c(0, 1, 0, 1)) + rr <- cor.test(x, y, method=par1) + r <- round(rr$p.value,2) + txt <- format(c(r, 0.123456789), digits=digits)[1] + txt <- paste(prefix, txt, sep='') + if(missing(cex.cor)) cex <- 0.5/strwidth(txt) + text(0.5, 0.5, txt, cex = cex) + } > panel.hist <- function(x, ...) + { + usr <- par('usr'); on.exit(par(usr)) + par(usr = c(usr[1:2], 0, 1.5) ) + h <- hist(x, plot = FALSE) + breaks <- h$breaks; nB <- length(breaks) + y <- h$counts; y <- y/max(y) + rect(breaks[-nB], 0, breaks[-1], y, col='grey', ...) + } > postscript(file="/var/www/html/rcomp/tmp/1a1oo1292168856.ps",horizontal=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > pairs(t(y),diag.panel=panel.hist, upper.panel=panel.smooth, lower.panel=panel.tau, main=main) > dev.off() null device 1 > > #Note: the /var/www/html/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab > load(file="/var/www/html/rcomp/createtable") > > n <- length(y[,1]) > n [1] 9 > a<-table.start() > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,paste('Correlations for all pairs of data series (method=',par1,')',sep=''),n+1,TRUE) > a<-table.row.end(a) > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,' ',header=TRUE) > for (i in 1:n) { + a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],header=TRUE) + } > a<-table.row.end(a) > for (i in 1:n) { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],header=TRUE) + for (j in 1:n) { + r <- cor.test(y[i,],y[j,],method=par1) + a<-table.element(a,round(r$estimate,3)) + } + a<-table.row.end(a) + } > a<-table.end(a) > table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/2ek5c1292168856.tab") > a<-table.start() > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,'Correlations for all pairs of data series with p-values',4,TRUE) > a<-table.row.end(a) > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,'pair',1,TRUE) > a<-table.element(a,'Pearson r',1,TRUE) > a<-table.element(a,'Spearman rho',1,TRUE) > a<-table.element(a,'Kendall tau',1,TRUE) > a<-table.row.end(a) > cor.test(y[1,],y[2,],method=par1) Pearson's product-moment correlation data: y[1, ] and y[2, ] t = 0.7708, df = 142, p-value = 0.4421 alternative hypothesis: true correlation is not equal to 0 95 percent confidence interval: -0.1000843 0.2257408 sample estimates: cor 0.0645484 > for (i in 1:(n-1)) + { + for (j in (i+1):n) + { + a<-table.row.start(a) + dum <- paste(dimnames(t(x))[[2]][i],';',dimnames(t(x))[[2]][j],sep='') + a<-table.element(a,dum,header=TRUE) + rp <- cor.test(y[i,],y[j,],method='pearson') + a<-table.element(a,round(rp$estimate,4)) + rs <- cor.test(y[i,],y[j,],method='spearman') + a<-table.element(a,round(rs$estimate,4)) + rk <- cor.test(y[i,],y[j,],method='kendall') + a<-table.element(a,round(rk$estimate,4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'p-value',header=T) + a<-table.element(a,paste('(',round(rp$p.value,4),')',sep='')) + a<-table.element(a,paste('(',round(rs$p.value,4),')',sep='')) + a<-table.element(a,paste('(',round(rk$p.value,4),')',sep='')) + a<-table.row.end(a) + } + } There were 36 warnings (use warnings() to see them) > a<-table.end(a) > table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/3st331292168856.tab") > > try(system("convert tmp/1a1oo1292168856.ps tmp/1a1oo1292168856.png",intern=TRUE)) character(0) > > > proc.time() user system elapsed 1.458 0.519 2.981